Nástroj na hodnotenie kvality genomickej atomizácie

Informácie o projekte

Názov projektu:Nástroj na hodnotenie kvality genomickej atomizácie
Študent:Matej Krivošík
Email študenta:krivosik7@uniba.sk
Školiteľ:doc. Mgr. Tomáš Vinař, PhD.
Email školiteľa:tomas.vinar@fmph.uniba.sk
GitHub:-

Popis projektu

Tvorba analytického nástroja určeného na hodnotenie kvality genomickej atomizácie, teda rozkladu genómových sekvencií na menšie homogénne úseky – atómové segmenty – na základe lokálnej podobnosti. Atomizácia, realizovaná pomocou algoritmu IMP (implementovaného v nástroji GEESE), umožňuje identifikovať potenciálne homologické regióny medzi sekvenciami. Úlohou nástroja bude overiť, ako presne a konzistentne tento proces prebehol, a poskytnúť kvantitatívne aj vizuálne ukazovatele kvality.

Zimný Semester

-

Letný Semester

-